Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.199e-7■■■■□ 20.9
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TARDBPQ13148 SEPT9-207ENST00000449803 3996 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.449e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 SEPT9-201ENST00000329047 4453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.499e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 SEPT9-206ENST00000431235 4004 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.649e-7■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-12■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 LMAN1-203ENST00000587918 678 ntTSL 24.95□□□□□ -1.622e-12■■■■□ 20.9
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TARDBPQ13148 SH3BP2-201ENST00000356331 9211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.763e-6■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 SH3BP2-209ENST00000504450 844 ntTSL 510.03□□□□□ -0.83e-6■■■■□ 20.9
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TARDBPQ13148 FAM182B-209ENST00000584356 610 ntTSL 49.59□□□□□ -0.876e-8■■■■□ 20.9
TARDBPQ13148 ZNF330-203ENST00000506302 1180 ntTSL 212.54□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.338e-7■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.645e-18■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 RMDN3-211ENST00000560905 1008 ntTSL 219.01■□□□□ 0.633e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.593e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 PPP2R3B-206ENST00000477110 5802 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.553e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 AP2A2-212ENST00000528195 562 ntTSL 318.45■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.543e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.513e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 RACGAP1-219ENST00000550149 570 ntTSL 418.1■□□□□ 0.493e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 SUN1-209ENST00000424128 633 ntTSL 518.02■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 SUN1-216ENST00000440380 537 ntTSL 517.85■□□□□ 0.453e-6■■■■□ 20.8
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TARDBPQ13148 RACGAP1-222ENST00000551145 584 ntTSL 417.61■□□□□ 0.413e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 RACGAP1-212ENST00000548320 554 ntTSL 417.61■□□□□ 0.413e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.43e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 HDGFL2-207ENST00000615225 3100 ntTSL 517.34■□□□□ 0.374e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.333e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 RACGAP1-213ENST00000548598 582 ntTSL 417.05■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 20.8
TARDBPQ13148 ZNF692-210ENST00000476503 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 316.97■□□□□ 0.313e-6■■■■□ 20.8
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