Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 KPNB1-207ENST00000579901 594 ntTSL 49.18□□□□□ -0.948e-8■■■□□ 17
ILF3Q12906 KPNB1-211ENST00000582097 2347 ntTSL 28.21□□□□□ -1.098e-8■■■□□ 17
ILF3Q12906 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.128e-8■■■□□ 17
ILF3Q12906 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.358e-8■■■□□ 17
ILF3Q12906 KPNB1-206ENST00000578718 550 ntTSL 33.5□□□□□ -1.858e-8■■■□□ 17
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ILF3Q12906 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.731e-6■■■□□ 17
ILF3Q12906 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.741e-6■■■□□ 17
ILF3Q12906 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.91e-7■■■□□ 17
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ILF3Q12906 FAM45A-205ENST00000487888 851 ntTSL 215.58■□□□□ 0.082e-6■■■□□ 17
ILF3Q12906 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 17
ILF3Q12906 FAM45A-202ENST00000448258 692 ntTSL 314.18□□□□□ -0.142e-6■■■□□ 17
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ILF3Q12906 GOSR1-212ENST00000581721 756 ntTSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.094e-9■■■□□ 17
ILF3Q12906 AC023055.1-201ENST00000546837 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.24e-9■■■□□ 17
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ILF3Q12906 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.914e-9■■■□□ 17
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ILF3Q12906 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.898e-7■■■□□ 17
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ILF3Q12906 BCAM-209ENST00000590624 991 ntTSL 1 (best)19.71■□□□□ 0.757e-8■■■□□ 16.9
ILF3Q12906 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.557e-8■■■□□ 16.9
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ILF3Q12906 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.212e-7■■■□□ 16.9
ILF3Q12906 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-7■■■□□ 16.9
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ILF3Q12906 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.095e-7■■■□□ 16.9
ILF3Q12906 INTS6-214ENST00000488009 452 ntTSL 58.13□□□□□ -1.115e-7■■■□□ 16.9
ILF3Q12906 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.255e-7■■■□□ 16.9
ILF3Q12906 INTS6-212ENST00000485178 474 ntTSL 54.29□□□□□ -1.725e-7■■■□□ 16.9
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ILF3Q12906 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.244e-7■■■□□ 16.9
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ILF3Q12906 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.481e-7■■■□□ 16.9
ILF3Q12906 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.961e-6■■■□□ 16.9
ILF3Q12906 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)14.54□□□□□ -0.081e-6■■■□□ 16.9
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ILF3Q12906 PHF20-207ENST00000461122 919 ntTSL 318.06■□□□□ 0.482e-6■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PHF20-206ENST00000452270 832 ntTSL 513.33□□□□□ -0.282e-6■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PHF20-203ENST00000374012 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-6■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PHF20-201ENST00000339089 1997 ntTSL 212.58□□□□□ -0.42e-6■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PHF20-211ENST00000481202 1635 ntTSL 1 (best)12.45□□□□□ -0.422e-6■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PHF20-208ENST00000461405 550 ntTSL 211.94□□□□□ -0.52e-6■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PHF20-202ENST00000374000 1814 ntTSL 1 (best)11.4□□□□□ -0.582e-6■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 SFXN5-208ENST00000463277 575 ntTSL 410.43□□□□□ -0.747e-13■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 SFXN5-209ENST00000464825 532 ntTSL 48.28□□□□□ -1.087e-13■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 ORC2-201ENST00000234296 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.777e-7■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 CDK19-205ENST00000460913 448 ntTSL 512.46□□□□□ -0.411e-6■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.32e-6■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.522e-7■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 DIAPH3-203ENST00000400319 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.032e-7■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 DIAPH3-202ENST00000377908 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.052e-7■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 DIAPH3-204ENST00000400320 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.052e-7■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 DIAPH3-201ENST00000267215 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.152e-7■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-11■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-11■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PPP1R18-204ENST00000488324 1328 ntTSL 313.99□□□□□ -0.174e-11■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PPP1R18-203ENST00000467662 1156 ntTSL 312.21□□□□□ -0.454e-11■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 PPP1R18-202ENST00000399199 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.564e-11■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.34e-7■■■□□ 16.8
ILF3Q12906 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.194e-7■■■□□ 16.8
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