Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FMODQ06828 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FMODQ06828 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FMODQ06828 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
FMODQ06828 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FMODQ06828 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
FMODQ06828 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms