Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
ITIH3Q06033 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITIH3Q06033 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms