Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SSBP1Q04837 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SSBP1Q04837 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms