Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ARID5AQ03989 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms