Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GCNT1Q02742 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms