Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PRCDQ00LT1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRCDQ00LT1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms