Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRX1P78414 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRX1P78414 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRX1P78414 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRX1P78414 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IRX1P78414 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRX1P78414 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRX1P78414 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRX1P78414 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRX1P78414 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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