Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
HERVK_113P63121 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
HERVK_113P63121 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms