Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
HERVK_113P61574 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HERVK_113P61574 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms