Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
EIF4A1P60842 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EIF4A1P60842 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms