Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UBASH3AP57075 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
UBASH3AP57075 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
UBASH3AP57075 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3AP57075 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3AP57075 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3AP57075 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3AP57075 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3AP57075 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
UBASH3AP57075 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
UBASH3AP57075 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms