Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RAG2P55895 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RAG2P55895 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RAG2P55895 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms