Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MVDP53602 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MVDP53602 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MVDP53602 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MVDP53602 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MVDP53602 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MVDP53602 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MVDP53602 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms