Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK8P49336 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK8P49336 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK8P49336 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK8P49336 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK8P49336 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK8P49336 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK8P49336 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK8P49336 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms