Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZEB1P37275 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZEB1P37275 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms