Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FDFT1P37268 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.2 ms