Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GPC1P35052 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GPC1P35052 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms