Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CD40LGP29965 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms