Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DUSP1P28562 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DUSP1P28562 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms