Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms