Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PRKACBP22694 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms