Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCLP19338 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCLP19338 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCLP19338 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCLP19338 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms