Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP2A2P16615 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP2A2P16615 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A2P16615 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A2P16615 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms