Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SAA2P0DJI9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms