Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK1P06493 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK1P06493 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK1P06493 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CDK1P06493 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK1P06493 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK1P06493 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK1P06493 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CDK1P06493 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CDK1P06493 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CDK1P06493 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDK1P06493 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDK1P06493 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms