Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DHX16O60231 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DHX16O60231 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DHX16O60231 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DHX16O60231 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DHX16O60231 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DHX16O60231 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DHX16O60231 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX16O60231 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX16O60231 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DHX16O60231 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms