Protein–RNA interactions for Protein: A6NKC9

SH2D7, SH2 domain-containing protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D7A6NKC9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SH2D7A6NKC9 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms