Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 GFOD1-202ENST00000379284 8061 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CD101-201ENST00000256652 3283 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF169-202ENST00000395395 1986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 NRG1-203ENST00000405005 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PGGHG-202ENST00000409479 3062 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 KCTD10-201ENST00000228495 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FIGNL1-211ENST00000611938 3543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RBM23-204ENST00000399922 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZMIZ1-AS1-201ENST00000428862 2851 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SORBS2-201ENST00000284776 5996 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LAMA4-219ENST00000522006 6438 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ARMC9-214ENST00000611582 5759 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AC233701.1-201ENST00000571452 4204 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO7B-202ENST00000409816 6694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 C14orf132-203ENST00000555004 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 NEK1-203ENST00000507142 5556 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ACP6-205ENST00000583509 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 HPS4-203ENST00000402105 3562 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SORL1-204ENST00000525532 3836 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 HERC2P9-203ENST00000528584 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PDK2-216ENST00000614357 2493 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 WBP1L-202ENST00000448841 4085 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 HS6ST1-201ENST00000259241 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 STYX-201ENST00000354586 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TRPV1-201ENST00000310522 2340 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TSGA10-201ENST00000355053 3037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 BIRC2-201ENST00000227758 3743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CLINT1-206ENST00000523094 3987 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AL138889.1-203ENST00000530000 6593 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CLIP1-202ENST00000358808 5880 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ELMSAN1-204ENST00000423556 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 RSPH4A-201ENST00000229554 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MUC6-201ENST00000421673 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PARP6-201ENST00000260376 2142 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRE-202ENST00000306042 4957 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CAMK2G-204ENST00000351293 3563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PHTF2-203ENST00000307305 4793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MYOM2-201ENST00000262113 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ITPRIP-202ENST00000337478 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 PTPRA-203ENST00000356147 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 BRINP3-201ENST00000367462 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 APOL3-203ENST00000397287 3626 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ZFAND5-201ENST00000237937 5310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 VPS18-201ENST00000220509 3895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AL591543.1-202ENST00000642095 4149 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR12-202ENST00000405846 4850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01291-201ENST00000377469 3662 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 GPR155-201ENST00000295500 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-9Q9BYP9 DUSP27-202ENST00000361200 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 241.4 ms