Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 C8orf34-208ENST00000523686 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 GDNF-208ENST00000620847 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 LINC00517-202ENST00000554257 3460 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 GABRA6-201ENST00000274545 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 DROSHA-220ENST00000513349 4681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 KLHL2-204ENST00000506761 2169 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TRHP20396 ERC1-213ENST00000543086 9241 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC016930.1-201ENST00000468766 2205 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 LINC01915-201ENST00000577994 2321 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 R3HDM2P1-201ENST00000505381 1960 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 MCM8-202ENST00000378883 3574 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 SPTLC3-201ENST00000399002 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 BEST3-212ENST00000553096 2929 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 RPL19P11-201ENST00000495944 589 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 LINC02495-203ENST00000636704 242 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 REG1CP-201ENST00000377435 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 SLC9A4-201ENST00000295269 4138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 ZNF544-206ENST00000596652 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 ZNF544-217ENST00000600220 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 IL16-201ENST00000302987 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TRHP20396 CC2D2A-204ENST00000503292 5175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 CORIN-202ENST00000502252 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 SZT2-210ENST00000634258 11045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 SLFN14-201ENST00000415846 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 LINC02099-202ENST00000522158 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 PLP1-223ENST00000621218 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNF24-203ENST00000432261 3149 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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