RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.75■□□□□ 0.27
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTEDQ86YR6 584 aa15.26■□□□□ 0.03
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOXD1Q16676 465 aa14.49□□□□□ -0.09
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MSH5O43196 834 aa13.97□□□□□ -0.17
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.78□□□□□ -0.36
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADRA2BP18089 450 aa12.72□□□□□ -0.37
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.41□□□□□ -0.42
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.07□□□□□ -0.48
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTEHQ6S545 545 aa11.79□□□□□ -0.52
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNF39Q9H2S5 420 aa11.79□□□□□ -0.52
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DCAF8L1A6NGE4 600 aa11.75□□□□□ -0.53
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJC5BQ9UF47 199 aa11□□□□□ -0.65
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.79□□□□□ -0.68
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.77□□□□□ -0.69
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.75□□□□□ -0.69
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DSG3P32926 999 aa10.72□□□□□ -0.69
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CAPN15O75808 1086 aa10.63□□□□□ -0.71
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHRDL2Q6WN34 429 aa10.45□□□□□ -0.74
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ABCB7O75027 752 aa10.29□□□□□ -0.76
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TRHP20396 242 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.2□□□□□ -0.78
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HAX1O00165 279 aa10.12□□□□□ -0.79
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 APLP2Q06481 763 aa10.06□□□□□ -0.8
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.98□□□□□ -0.81
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LHX8Q68G74 356 aa9.93□□□□□ -0.82
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NPM3O75607 178 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EHMT2Q96KQ7 1210 aa9.85□□□□□ -0.83
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EVX2Q03828 476 aa9.83□□□□□ -0.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AKT1S1Q96B36 256 aa9.83□□□□□ -0.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KCNA4P22459 653 aa9.79□□□□□ -0.84
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.74□□□□□ -0.85
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POLA2Q14181 598 aa9.7□□□□□ -0.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PITPNM1O00562 1244 aa9.66□□□□□ -0.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC4A2P04920 1241 aa9.66□□□□□ -0.86
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GABBR2O75899 941 aa9.58□□□□□ -0.88
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CSRNP3Q8WYN3 585 aa9.57□□□□□ -0.88
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C19orf67A6NJJ6 358 aa9.46□□□□□ -0.9
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OSCARQ8IYS5 282 aa9.43□□□□□ -0.9
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTEMA6NI47 508 aa9.42□□□□□ -0.9
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTEGQ6S5H5 508 aa9.35□□□□□ -0.91
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTEIP0CG38 1075 aa9.34□□□□□ -0.91
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDH10Q9P2E7 1040 aa9.29□□□□□ -0.92
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.22□□□□□ -0.93
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC24A1O60721 1099 aa9.2□□□□□ -0.94
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OTUD5Q96G74 571 aa9.2□□□□□ -0.94
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DCBLD2Q96PD2 775 aa9.19□□□□□ -0.94
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZBTB22O15209 634 aa9.11□□□□□ -0.95
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CHADLQ6NUI6 762 aa9.1□□□□□ -0.95
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CLCN6P51797 869 aa9.09□□□□□ -0.95
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CD44P16070 742 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPDYE2BA6NHP3 402 aa9.04□□□□□ -0.96
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPDYE6P0CI01 402 aa9.04□□□□□ -0.96
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPDYE2Q495Y8 402 aa9.04□□□□□ -0.96
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTEB2H3BUK9 544 aa9.02□□□□□ -0.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRR29P0C7W0 189 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FBLN2P98095 1184 aa8.82□□□□□ -1
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.81□□□□□ -1
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.8□□□□□ -1
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.79□□□□□ -1
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.77□□□□□ -1.01
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.76□□□□□ -1.01
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POTEJP0CG39 1038 aa8.71□□□□□ -1.02
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.71□□□□□ -1.02
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 METRNQ9UJH8 293 aa8.71□□□□□ -1.02
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MMRN1Q13201 1228 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms