Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MAPRE3Q9UPY8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms