Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI1

NWD2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD2Q9ULI1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NWD2Q9ULI1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms