Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TSPAN16Q9UKR8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TSPAN16Q9UKR8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms