Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RIMS3Q9UJD0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms