Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USP25Q9UHP3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
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