Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DKK4Q9UBT3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DKK4Q9UBT3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms