Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CHMP5Q9NZZ3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms