Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GDAP2Q9NXN4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GDAP2Q9NXN4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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