Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVK13-1Q9NX77 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVK13-1Q9NX77 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms