Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
FZD3Q9NPG1 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FZD3Q9NPG1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms