Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB18Q9NP72 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB18Q9NP72 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms