Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
POLR2J2Q9GZM3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
POLR2J2Q9GZM3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms