Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC106Q9BWC9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCDC106Q9BWC9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms