Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RBM42Q9BTD8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RBM42Q9BTD8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms