Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BPIFA3Q9BQP9 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BPIFA3Q9BQP9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms