Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TUBA1CQ9BQE3 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TUBA1CQ9BQE3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms