Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
APOL4Q9BPW4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms