Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RIT2Q99578 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RIT2Q99578 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms